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Virologie

Sommaire

Introduction

1 - Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales

2 - Les Herpesviridae - 1ère partie (HSV et VZV)

3 - Les Herpesviridae - 2ème partie (CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8 et virus B du singe)

4 - Rétrovirus humains - 1ère partie (le VIH ou HIV)

5 - Rétrovirus humains - 2ème partie (HTLV) et virus des hépatites - 1ère partie (hépatite A - VHA ou HAV, hépatite B - VHB ou HBV)

6 - Virus des hépatites - 2ème partie

7 - Les virus respiratoires - 1ère partie

8 - Les virus respiratoires - 2ème partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubéole

9 - Entérovirus et virus des gastroentérites

10 - « Autres virus à ADN » : adénovirus, polyomavirus, papillomavirus, parvovirus, poxvirus

11 - Agents des encéphalopathies spongiformes ou ATNC (agents transmissibles non conventionnels)

12 - Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits émergents

A - Calendrier des vaccinations 2005 - Tableau synoptique

B - Calendrier vaccinal 2005

C - Récapitulatif : diagnostic, prévention, traitement

D - Aide-mémoire de chimiothérapie antivirale

E - Les examens virologiques en pratique médicale

F - Recommandations de traitement pour hépatite chronique

G - Vingt ans après

H - Évaluation de l’enseignement de la virologie. Année 2007

I - Remerciements

Tous droits de reproduction réservés aux auteurs

traduction HTML V2.7
V. Morice

Sommaire

 

 

Sommaire

Introduction

  1  Introduction générale et buts de l’enseignement de la virologie en DCEM1
  2  Conseils du Pr J.M. Huraux aux Étudiants pour les examens
  3  Objectifs de l’enseignement de virologie aux étudiants en médecine
  3.1  Objectifs généraux
  3.2  Objectifs particuliers aux différents virus d’intérêt médical
  3.3  Démarches diagnostiques, épidémiologiques et préventives
  4  Liste de questions rédactionnelles pour l’examen de DCEM-1 2007

Chapitre 1 - Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales

  1.1  Qu’est-ce qu’un virus ?
  1.1.1  Génome
  1.1.2  Capside
  1.1.2.1  Nucléocapside tubulaire ou hélicoïdale
  1.1.2.2  Nucléocapside polyédrique
  1.1.3  Enveloppe ou péplos
  1.1.3.1  Définition
  1.1.3.2  Virus nus
  1.1.3.3  Que cela change-t-il d’avoir ou de ne pas avoir de péplos ?
  1.1.3.4  La transmission de la grippe
  1.1.3.5  La transmission de la poliomyélite, du virus de l’hépatite A et des entérovirus en général
  1.1.4  Classification des virus
  1.1.5  Agents des encéphalopathies spongiformes transmissibles ou ATNC (agents transmissibles non conventionnels)
  1.2  Multiplication des virus
  1.2.1  Conditions nécessaires à la multiplication d’un virus
  1.2.2  La multiplication d’un virus comporte six étapes
  1.2.2.1  Attachement
  1.2.2.2  Pénétration
  1.2.2.3  Décapsidation
  1.2.2.4  Réplication
  1.2.2.5  Assemblage
  1.2.2.6  Libération
  1.2.3  Conséquences de la multiplication virale pour la cellule infectée
  1.2.3.1  Mort de la cellule
  1.2.3.2  Tolérance de l’infection
  1.2.3.3  Transformation cellulaire maligne
  1.3  Moyens de défense contre l’infection virale
  1.3.1  À la frontière, la peau et les muqueuses
  1.3.2  Immunité naturelle, innée
  1.3.3  Immunité acquise, spécifique
  1.3.3.1  Schéma général
  1.3.3.2  Anticorps
  1.3.3.3  Lymphocytes T CD8+ Cytotoxiques ou CTL
  1.3.4  Interactions et « ambivalence » des moyens de défenses
  1.3.5  Immunodépression et infections virales
  1.3.6  Échappement des virus aux défenses immunitaires
  1.3.6.1  Le camouflage
  1.3.6.2  Sabotage
  1.4  Expression clinique de l’infection
  1.4.1  Infections aiguës
  1.4.2  Infections chroniques
  1.5  Lutte contre les infections virales
  1.5.1  Immunothérapie passive
  1.5.2  Immunothérapie active
  1.5.2.1  Vaccins inactivés (« tués »)
  1.5.2.2  Vaccins atténués (« vivants »)
  1.5.2.3  Trois nouvelles catégories de vaccin
  1.5.3  Chimiothérapie antivirale
  1.5.3.1  IDU (Iduviran®)
  1.5.3.2  Aciclovir (ACV)
  1.5.3.3  Nucléosides anti-HIV
  1.5.3.4  Trois autres catégories d’anti-HIV ont été mises au point
  1.5.4  Mesures d’hygiène : last but not least
  1.6  Points importants

Chapitre 2 - Les Herpesviridae - 1ère partie (HSV et VZV)

  2.1  Généralités sur les Herpesviridae
  2.2  Les deux virus de l’herpès, ou herpes simplex virus type 1 et type 2 (HSV-1, HSV2)
  2.2.1  L’HSV-1 et l’HSV-2 se partagent le corps
  2.2.2  Manifestations habituelles des infections à HSV-1
  2.2.3  Herpes simplex virus type 2 (HSV-2)
  2.2.4  Infections graves
  2.2.4.1  Parfois la primo-infection à HSV-1 touche l’œil
  2.2.4.2  L’herpès du nouveau-né est une infection encore plus grave
  2.2.4.3  Troisième forme redoutable d’infection herpétique : l’encéphalite herpétique de l’adulte
  2.2.4.4  L’herpès chez l’hôte aux défenses antivirales affaiblies
  2.2.5  Diagnostic au laboratoire de virologie des infections à HSV-1 et HSV-2
  2.2.5.1  Les indications : faire ou ne pas faire un examen virologique ?
  2.2.5.2  Prélèvement
  2.2.5.3  Technique de détection
  2.2.5.4  Interprétation
  2.2.6  Traitement
  2.2.7  Points importants
  2.3  Virus de la varicelle et du zona (VZV)
  2.3.1  Varicelle
  2.3.2  Zona
  2.3.3  Transmission de l’infection à VZV
  2.3.4  Diagnostic
  2.3.5  Traitement des infections à VZV
  2.3.5.1  Traitement curatif
  2.3.5.2  Traitement préventif
  2.3.6  Points importants

Chapitre 3 - Les Herpesviridae - 2ème partie (CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8 et virus B du singe)

  3.1  Le cytomégalovirus humain (HCMV ou plus couramment CMV)
  3.1.1  Le virus
  3.1.2  Épidémiologie
  3.1.3  Infection du nouveau-né
  3.1.4  L’adulte immunocompétent
  3.1.5  Les personnes immunodéprimées
  3.1.6  Diagnostic au laboratoire
  3.1.6.1  Diagnostic direct
  3.1.6.2  Diagnostic indirect
  3.1.6.3  Interprétation
  3.1.7  Prévention et traitement
  3.1.8  Points importants
  3.2  Le virus Epstein-Barr (virus E-B ou EBV)
  3.2.1  Historique
  3.2.2  Mononucléose infectieuse
  3.2.2.1  Description
  3.2.2.2  Complications
  3.2.2.3  Épidémiologie de la mononucléose infectieuse
  3.2.3  Physiopathologie de la mononucléose infectieuse
  3.2.4  Infection latente
  3.2.5  EBV et cancer
  3.2.6  Diagnostic de l’infection par EBV et de la mononucléose infectieuse au laboratoire
  3.2.7  L’EBV, outil de laboratoire
  3.2.8  Points importants
  3.3  Herpèsvirus humain type 6 ou HHV-6
  3.4  Herpèsvirus humain type 8 ou HHV-8
  3.5  Herpesvirus simiæ ou virus B du singe

Chapitre 4 - Rétrovirus humains - 1ère partie (le VIH ou HIV)

  4.1  Introduction : généralités sur les rétrovirus
  4.2  L’HIV ou VIH, virus de l’immunodéficience humaine
  4.2.1  Structure du virus
  4.2.2  Cycle de multiplication de l’HIV au niveau de la cellule
  4.2.2.1  L’attachement
  4.2.2.2  La transcriptase inverse ou rétrotranscriptase (RT)
  4.2.2.3  Un mécanisme complexe de régulation
  4.2.3  La multiplication virale au niveau de l’organisme
  4.2.4  Épidémiologie
  4.2.5  L’HIV-2
  4.2.6  Diagnostic virologique et suivi au laboratoire de l’infection à VIH
  4.2.6.1  Dépistage
  4.2.6.2  Isolement du virus en culture de cellules
  4.2.6.3  Virologie moléculaire
  4.2.6.4  Indications des examens
  4.2.7  Thérapeutique antivirale
  4.2.8  Prospective
  4.2.9  Points importants

Chapitre 5 - Rétrovirus humains - 2ème partie (HTLV) et virus des hépatites - 1ère partie (hépatite A - VHA ou HAV, hépatite B - VHB ou HBV)

  5.1  Rétrovirus humains - 2ème partie : HTLV
  5.2  Les « virus des hépatites »
  5.3  Caractères généraux des hépatites virales aiguës
  5.4  Le virus de l’hépatite A (VHA ou HAV)
  5.5  Le virus de l’hépatite B (VHB ou HBV)
  5.5.1  Structure du virus
  5.5.2  Multiplication
  5.5.3  La transmission de l’HBV
  5.5.4  Histoire naturelle de l’infection et évolution des antigènes, des anticorps et de l’ADN viral dans le sérum
  5.5.5  Traitement
  5.5.5.1  Traitement curatif
  5.5.5.2  Prévention
  5.5.6  Un problème très important de santé publique
  5.5.7  HBV et mutations
  5.6  Points importants

Chapitre 6 - Virus des hépatites - 2ème partie

  6.1  Le virus delta ou virus de l’hépatite D (HDV)
  6.2  Le virus de l’hépatite C (HCV)
  6.2.1  Le virus
  6.2.2  Épidémiologie et histoire naturelle
  6.2.3  Diagnostic
  6.2.4  Le traitement
  6.3  Le virus de l’hépatite E ou HEV
  6.4  Le virus dit de l’hépatite G et le TTV
  6.5  Points importants

Chapitre 7 - Les virus respiratoires - 1ère partie

  7.1  Virus de la grippe ou virus influenza
  7.1.1  Clinique de la grippe
  7.1.2  Parcours du virus de la grippe dans l’organisme
  7.1.3  Morts par grippe
  7.1.4  Virus de la grippe ou virus influenza et modifications antigéniques
  7.1.5  Diagnostic au laboratoire
  7.1.5.1  Détection du virus
  7.1.5.2  Sérodiagnoctic
  7.1.5.3  Indications
  7.1.6  Traitement et prévention de la grippe
  7.1.6.1  Traitement symptomatique
  7.1.6.2  Vaccination
  7.1.6.3  Rimantadine
  7.1.6.4  Zanamir et oseltamivir
  7.1.6.5  Au total
  7.1.7  Points importants

Chapitre 8 - Les virus respiratoires - 2ème partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubéole

  8.1  Virus respiratoires (2ème partie)
  8.1.1  Généralités sur la famille des Paramyxoviridae
  8.1.1.1  Structure
  8.1.1.2  Transmission
  8.1.2  Les virus para-influenza
  8.1.2.1  Manifestations cliniques
  8.1.2.2  Traitement de ces laryngites
  8.1.2.3  Diagnostic virologique
  8.1.2.4  Vaccination
  8.1.3  Virus respiratoire syncytial
  8.1.3.1  L’infection
  8.1.3.2  Diagnostic au laboratoire
  8.1.3.3  Traitement
  8.1.3.4  Métapneumovirus humain
  8.1.4  Coronavirus
  8.1.5  Rhinovirus
  8.2  Virus des oreillons ou virus ourlien
  8.2.1  Le virus
  8.2.2  Diagnostic virologique
  8.2.3  Traitement
  8.3  Virus de la rougeole
  8.3.1  Manifestations cliniques
  8.3.2  Diagnostic virologique
  8.3.3  Vaccin
  8.4  Points importants
  8.5  Virus de la rubéole
  8.5.1  Le virus
  8.5.2  Primo-infection rubéolique
  8.5.2.1  Diagnostic clinique
  8.5.2.2  Diagnostic au laboratoire
  8.5.3  Réinfection rubéolique
  8.5.4  Rubéole congénitale
  8.5.4.1  Signes
  8.5.4.2  Diagnostic au laboratoire
  8.5.4.3  Evaluation du risque
  8.5.5  Conduite à tenir chez une femme enceinte
  8.5.5.1  Examen pour éruption en cours de grossesse
  8.5.5.2  Examen pour contage en cours de grossesse
  8.5.5.3  Examen systématique en cours de grossesse
  8.5.6  Récapitulatif des dates des prélèvements et des indications de la recherche des IgM rubéoliques
  8.5.6.1  Dates de prélèvement
  8.5.6.2  Indications de la recherche des IgM rubéoliques
  8.5.7  Traitement
  8.5.7.1  Le vaccin
  8.5.7.2  Qui vacciner ?
  8.5.8  Points importants

Chapitre 9 - Entérovirus et virus des gastroentérites

  9.1  Entérovirus
  9.1.1  Généralités sur les entérovirus
  9.1.1.1  Définition
  9.1.1.2  Structure et implications épidémiologiques
  9.1.1.3  Multiplication
  9.1.1.4  Caractères antigéniques
  9.1.1.5  Pouvoir pathogène
  9.1.2  Poliomyélite et poliovirus
  9.1.2.1  Clinique
  9.1.2.2  Parcours de l’infection dans l’organisme
  9.1.2.3  Diagnostic au laboratoire
  9.1.2.4  Vaccination contre la poliomyélite
  9.1.3  Échovirus et coxsackievirus
  9.1.3.1  Clinique
  9.1.3.2  Diagnostic
  9.1.3.3  Traitement
  9.2  Virus des gastroentérites
  9.2.1  Rotavirus
  9.2.2  Petits virus nus à ARN responsable de gastroentérites
  9.2.3  Adénovirus des gastroentérites
  9.3  Points importants

Chapitre 10 - « Autres virus à ADN » : adénovirus, polyomavirus, papillomavirus, parvovirus, poxvirus

  10.1  Adénovirus
  10.1.1  Clinique
  10.1.2  Diagnostic au laboratoire
  10.1.2.1  Diagnostic direct
  10.1.2.2  Diagnostic indirect : le sérodiagnostic
  10.1.2.3  Indications de ces examens virologiques
  10.1.3  Pouvoir cancérigène des adénovirus
  10.1.4  Traitement
  10.2  Papovavirus
  10.2.1  Généralités
  10.2.2  Famille des Polyomaviridae
  10.2.3  Famille des Papillomaviridae
  10.3  Parvovirus
  10.4  Poxvirus
  10.4.1  Généralités
  10.4.2  Variole
  10.4.3  Vaccine
  10.4.4  Actualité de la variole
  10.4.5  Poxviroses professionnelles
  10.4.6  Monkey pox
  10.4.7  Molluscum contagiosum
  10.5  Points importants
  10.5.1  Adénovirus ou ADV
  10.5.2  Polyomavirus humains, BK et JC virus
  10.5.3  Papillomavirus humains ou HPV
  10.5.4  Parvovirus humain B19
  10.5.5  Poxvirus

Chapitre 11 - Agents des encéphalopathies spongiformes ou ATNC (agents transmissibles non conventionnels)

  11.1  Des maladies extraordinaires
  11.2  Des agents extraordinaires
  11.3  L’hypothèse du prion ou de la « protéine seule »
  11.4  ESB et nvMCJ
  11.5  Les différentes catégories de MCJ

Chapitre 12 - Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits émergents

  12.1  Virus de la rage
  12.1.1  Le virus rabique
  12.1.2  Réservoir du virus
  12.1.3  La contamination de l’homme
  12.1.4  Trajet du virus
  12.1.5  Signes de la rage
  12.1.6  Mesure à prendre
  12.1.6.1  Vis-à-vis de l’animal
  12.1.6.2  Vis-à-vis du sujet mordu
  12.1.6.3  Cas particuliers des chauves-souris
  12.1.6.4  Prévention
  12.1.7  Points importants
  12.2  Arbovirus
  12.2.1  Définition
  12.2.2  Parcours habituel du virus dans l’organisme
  12.2.3  Fièvre jaune (virus amaril)
  12.2.3.1  Historique
  12.2.3.2  Les cycles
  12.2.3.3  Clinique
  12.2.3.4  Diagnostic
  12.2.3.5  Traitement préventif
  12.2.4  Encéphalites à arbovirus
  12.2.5  La dengue
  12.2.6  Points importants
  12.3  Infections à forte mortalité par filovirus, arénavirus, et hantavirus et autres virus émergents
  12.3.1  Les filovirus : le virus Marburg et le virus Ebola
  12.3.2  Les arénavirus
  12.3.3  Le virus Hantaan
  12.3.4  Conditions de manipulation
  12.4  En guise de conclusion au cours de virologie médicale

Annexe A - Calendrier des vaccinations 2005 - Tableau synoptique

Annexe B - Calendrier vaccinal 2005

  B.1  Nouvelles recommandations
  B.2  Recommandations générales
  B.3  Risques professionnels
  B.4  Recommandations particulières
  B.5  Recommandations vaccinales aux voyageurs

Annexe C - Récapitulatif : diagnostic, prévention, traitement

Annexe D - Aide-mémoire de chimiothérapie antivirale

Annexe E - Les examens virologiques en pratique médicale

  E.1  Diagnostic des infections virales
  E.1.1  Deux approches
  E.1.2  Diagnostic direct
  E.1.2.1  Microscopie électronique
  E.1.2.2  Recherche de virus infectieux après inoculation de culture cellulaire in vitro
  E.1.2.3  Détection rapide d’antigène viral directement dans les produits biologiques
  E.1.2.4  Détection des génomes viraux directement dans les produits biologiques
  E.1.3  Diagnostic indirect
  E.1.3.1  Différentes techniques
  E.1.3.2  Que chercher par le diagnostic indirect ou sérodiagnostic ?
  E.1.3.3  Limites du diagnostic indirect
  E.2  Rôle du praticien
  E.2.1  Les prélèvements
  E.2.2  Renseignements cliniques et interprétation des résultats
  E.2.3  Indication des examens virologiques en pratique médicale
  E.3  Quantification de la virémie, « seuil d’intervention » et « traitement anticipé » (preemptive)
  E.4  Suivi des traitements antiviraux
  E.5  Conclusion

Annexe F - Recommandations de traitement pour hépatite chronique

Annexe G - Vingt ans après

Annexe H - Évaluation de l’enseignement de la virologie. Année 2007

Annexe I - Remerciements

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