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Structures Biologiques

Plan du cours

Objectifs

I - Les glucides

1 - Définitions et formules. Propriétés générales

2 - Oses simples

3 - Dérivés des oses

4 - Polyosides

5 - Hétérosides

II - Les lipides

6 - Définitions

7 - Acides gras

8 - Alcools des lipides

9 - Lipides neutres

10 - Lipides complexes

III - Protéines : les acides aminés

11 - Formules

12 - Propriétés générales

13 - Dérivés des acides aminés

IV - Les protéines

14 - Définitions

15 - La structure primaire

16 - La structure secondaire

17 - La structure tertiaire

18 - La structure quaternaire


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traduction HTML V2.8
V. Morice


Partie IV - Les protéines
Chapitre 16 - La structure secondaire

 

16.4 - Table de Ramachandran

 

Image ST_90_PICT.gif
ST 90

  • Si on représente sur un graphe, toutes les structures secondaires possibles en indiquant en ordonnées la variation de l’angle Ψ et en abcisse la variation de l’angle Φ, on obtient un tableau où peuvent être indiquées les plus probables de ces structures (table de Ramachandran).
  • Toutes les structures secondaires représentées par les coordonnées de ce graphe ne peuvent pas se réaliser par suite de l’encombrement des atomes voisins. Il existe des zones privilégiées permettant la constitution d’hélices ou de feuillets rencontrés fréquemment dans les protéines.
  • L’hélice a droite (Φ = 123°, Ψ = 133°) est une hélice dont le pas est d’environ 4 acides aminés et qui tourne dans le sens des aiguilles d’une montre lorsqu’on va de l’extrémité NH2-terminale vers l’extrémité COOH-terminale. C’est la structure secondaire la plus fréquente. La même hélice tournant à gauche est possible mais ne se rencontre pas dans la nature. L’hélice C d’un pas de 3 acides aminés se voit dans la structure du collagène.
  • Les feuillets β plissés dans lesquels les chaînons d’acides aminés peuvent être parallèles ou antiparallèles sont également très fréquents dans la structure des protéines globulaires.

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16.1 - STRUCTURE SECONDAIRE
16.2 - Liaison peptidique
16.3 - Angles de rotation
16.4 - Table de Ramachandran
16.5 - Hélice α
16.6 - Feuillet β
16.7 - Motif Rossmann