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Enzymologie élémentaire

Plan du cours

Objectifs

I - Les enzymes

1 - Définitions

2 - La réaction enzymatique

II - Cinétique

3 - Effet de la concentration d’enzyme

4 - Effet de la concentration de substrat

5 - Effet de la concentration des effecteurs

6 - Effets allostériques

7 - Cinétique à deux substrats

III - Effet des constantes physiques

8 - Effet du pH

9 - Effet de la température


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traduction HTML V2.8
V. Morice


Partie III - Effet des constantes physiques
Chapitre 9 - Effet de la température

 

9.6 - Energie interne de la fumarase

 

Image EE_62_1_PICT.jpg
EE 62/1

  • Suivons donc l’évolution de l’énergie interne des complexes au cours de l’action de cette enzyme.
  • L’enzyme et le substrat libre au début possèdent ensemble une énergie interne E + S.
  • Le milieu va communiquer à ces molécules une énergie cinétique de 17,5 kJ/mol pour que la collision d’une molécule de substrat sur l’enzyme soit assez forte pour faire entrer le fumarate dans la cavité du site de fixation (ES*). Le complexe enzyme-substrat ainsi formé va recevoir ensuite du milieu une énergie d’activation (25,5 kJ/mol) qui va le porter à un état activé (EX*) qui permettra l’addition d’une molécule d’eau sur la double liaison.
  • Dès que cette réaction est faite, une énergie de 63 kJ/mol est libérée dans le milieu.
  • Le complexe enzyme-produit (EP) devra être encore réactivé par le milieu (5 kJ/mol = EP*) pour arracher la molécule de malate à la cavité du site actif.
  • A l’état final, libres dans le milieu, la fumarase et le malate (E + P), ont ensemble une énergie interne inférieure de 15 kJ/mol à l’énergie interne du substrat et de l’enzyme au départ de la réaction.

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9.1 - Température optimum
9.2 - Activation ; dénaturation
9.3 - Relation d’Arrhenius
9.4 - Energie d’activation
9.5 - Exemple d’énergie d’activation : la fumarase
9.6 - Energie interne de la fumarase
9.7 - Energie d’activation
9.8 - Réaction couplée
9.9 - Exemple de réaction couplée : l’hexokinase
9.10 - Exemple de réaction couplée : la phosphoglycérate kinase
9.11 - Liaisons riches en énergie
9.12 - Liaison riche en énergie