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Enzymologie élémentaire

Plan du cours

Objectifs

I - Les enzymes

1 - Définitions

2 - La réaction enzymatique

II - Cinétique

3 - Effet de la concentration d’enzyme

4 - Effet de la concentration de substrat

5 - Effet de la concentration des effecteurs

6 - Effets allostériques

7 - Cinétique à deux substrats

III - Effet des constantes physiques

8 - Effet du pH

9 - Effet de la température


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traduction HTML V2.8
V. Morice


Partie II - Cinétique
Chapitre 7 - Cinétique à deux substrats

 

7.4 - Exemple de bibi ordonné : la phosphoglycéraldéhyde déshydrogénase

 

Image EE_49_2_PICT.jpg
EE 49/2

  • La phosphoglycéraldéhyde déshydrogénase est une enzyme qu’on trouve dans toutes les cellules. Elle catalyse l’oxydation du phosphoglycéraldéhyde en 1,3-diphosphoglycérate en réduisant simultanément un coenzyme NAD+ en NADH.
  • Cette réaction se déroule selon un mécanisme de type bibi ordonné : l’enzyme n’a pas d’affinité pour le phosphoglycéraldéhyde si elle n’est pas préalablement associée au coenzyme NAD+ en un premier complexe ; puis le complexe ternaire Enzyme-NAD+-Phosphoglycéraldéhyde se transforme en un complexe Enzyme-NADH-Diphosphoglycérate ; ce dernier complexe se dissocie en libérant le diphosphoglycérate puis le NAD réduit.
  • De nombreuses autres déshydrogénases utilisant le NAD comme coenzyme suivent un mécanisme de type bibi ordonné.

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7.1 - Mécanisme bibi ordonné
7.2 - Exemple de bibi ordonné : l’alcool déshydrogénase
7.3 - Exemple de bibi ordonné : la malate déshydrogénase
7.4 - Exemple de bibi ordonné : la phosphoglycéraldéhyde déshydrogénase
7.5 - Exemple de bibi ordonné : l’UDP-glucose pyrophosphorylase
7.6 - Mécanisme bibi aléatoire
7.7 - Exemple de bibi aléatoire : la créatine phosphokinase
7.8 - Exemple de bibi aléatoire : la citrate synthase
7.9 - Mécanisme ping-pong
7.10 - Exemple de ping-pong : l’alanine aminotransférase = ALAT
7.11 - Exemple de ping-pong : l’aspartate aminotransférase = ASAT
7.12 - Exemple de ping-pong : la phosphoénolpyruvate carboxykinase = PEPCK