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Biologie Moléculaire

Plan du cours

Objectifs PAES commun DHU Paris-Est

I - La structure des acides nucléiques

1 - Molécules simples

2 - Les acides nucléiques

II - Biosynthèse des macromolécules

III - Les événements génétiques

8 - Substitutions

9 - Mutations

10 - Insertions - délétions

11 - Transpositions

IV - L’évolution

12 - Divergence

13 - Familles de gènes

V - Le DNA au laboratoire

14 - Méthodes d’étude

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V. Morice

Plan du cours

Objectifs PAES commun DHU Paris-Est

Partie I - La structure des acides nucléiques

Chapitre 1 - Molécules simples

	1.1	Phosphates
	1.2	Ribose, désoxyribose
	1.3	Purine, Pyrimidine
	1.4	Bases puriques
	1.5	Bases pyrimidiques
	1.6	Nucléosides et nucléotides
	1.7	Nomenclature des unités nucléotidiques
	1.8	Adénosine
	1.9	Désoxyguanosine
	1.10	Uridine MonoPhosphate
	1.11	Désoxythymidine MonoPhosphate
	1.12	Adénosine Tri Phosphate
	1.13	Désoxycytidine Tri Phosphate
	1.14	Liaisons hydrogène
	1.15	Hybridation A - T
	1.16	Hybridation G - C

Chapitre 2 - Les acides nucléiques

	2.1	Acide ribonucléique
	2.2	Les extrémités 5’ et 3’ d’un acide nucléique
	2.3	Structure secondaire du RNA
	2.4	Acides ribonucléiques
	2.5	Acide désoxyribonucléique
	2.6	La double hélice (modèle rubans)
	2.7	La double hélice (travers)
	2.8	La double hélice (axe)
	2.9	Surenroulement
	2.10	Nucléosome
	2.11	Fibre de chromatine
	2.12	Condensation et hydrolyse des nucléotides
	2.13	Complémentarité des bases

Partie II - Biosynthèse des macromolécules

Chapitre 3 - DNA Définitions

	3.1	La double hélice
	3.2	Séquence d’un gène (apoA-II)
	3.3	Gène
	3.4	Expression d’un gène

Chapitre 4 - La transcription

	4.1	Transcription
	4.2	Promoteur
	4.3	Brins sens et antisens
	4.4	Régulation de l’expression
	4.5	Cis et trans régulateurs
	4.6	DNA binding proteins
	4.7	Interaction Protéine DNA
	4.8	Récepteurs nucléaires
	4.9	Régulation du jeûne
	4.10	Régulation de l’effort
	4.11	RNA polymérase II
	4.12	Initiation de la transcription
	4.13	Liaison TFIID sur le DNA
	4.14	Régulation de la RNA polymérase
	4.15	Elongation de la transcription
	4.16	Elongation de la transcription
	4.17	Discontinuité des gènes
	4.18	Exon
	4.19	Exon 1
	4.20	Fin de la transcription
	4.21	Modifications du transcrit
	4.22	Enzyme coiffante
	4.23	Coiffe d’un messager
	4.24	Queue polyA
	4.25	Le transcrit primaire
	4.26	Excision - épissage
	4.27	Formation du lasso
	4.28	Epissages alternatifs
	4.29	Maturation des RNA ribosomiques
	4.30	Stabilité du messager
	4.31	Messager

Chapitre 5 - La traduction

	5.1	Traduction
	5.2	Expression d’un gène
	5.3	Signifiants
	5.4	Codon
	5.5	Code génétique
	5.6	Code génétique
	5.7	Code dégénéré
	5.8	Ribosome eucaryote
	5.9	Polyribosome
	5.10	RNA de transfert (trèfle)
	5.11	RNA de transfert (ruban)
	5.12	Activation d’un acide aminé
	5.13	Sérine tRNA synthétase
	5.14	Cystéine tRNA synthétase
	5.15	Initiation de la traduction
	5.16	Cadre de lecture
	5.17	Elongation de la traduction
	5.18	Incorporation d’un acide aminé
	5.19	Transfert du peptide
	5.20	Translocation des codons
	5.21	Liaisons riches en énergie
	5.22	Terminaison de la traduction
	5.23	Signal-peptide
	5.24	Polyribosomes liés
	5.25	Carboxylation de l’acide glutamique
	5.26	Modifications post-traductionnelles

Chapitre 6 - La réplication

	6.1	Réplication
	6.2	Le cycle cellulaire
	6.3	Chromatine et ADN
	6.4	Réplication semi-conservative
	6.5	Synthèse et hydrolyse du DNA
	6.6	DNA polymérase
	6.7	DNA polymérase (exonucléase 3’→5’)
	6.8	DNA polymérase : fonction d’édition
	6.9	Boucle de réplication
	6.10	Fourche de réplication
	6.11	Topoisomérase I
	6.12	Primase
	6.13	DNA ligase
	6.14	Télomérase

Chapitre 7 - La réparation

	7.1	Réparation
	7.2	Systèmes de réparation du DNA
	7.3	Bases endommagées
	7.4	Excision de base
	7.5	Mésappariements
	7.6	Transmission du mésappariement
	7.7	Excision de fragment long
	7.8	Modèle Holliday
	7.9	Coupure du double brin
	7.10	Crossing-over

Partie III - Les événements génétiques

Chapitre 8 - Substitutions

	8.1	Substitution
	8.2	Somatique, germinale
	8.3	Faux-sens, non-sens
	8.4	Polymorphisme Xba I de l’apoB
	8.5	Marqueur génétique

Chapitre 9 - Mutations

	9.1	Mutation
	9.2	Mutation Arg3500→Gln de l’apoB-100

Chapitre 10 - Insertions - délétions

	10.1	Délétion
	10.2	Décalage du cadre de lecture
	10.3	Délétion Phe 508 de CFTR
	10.4	Délétion de l’exon 9 de la lipoprotéine-lipase
	10.5	Mutation d’un site d’épissage
	10.6	Insertion

Chapitre 11 - Transpositions

	11.1	Transposition
	11.2	Séquence Alu
	11.3	Virus
	11.4	Cycle d’un rétrovirus
	11.5	Duplication de gène
	11.6	Pseudogène
	11.7	Conversion de gène

Partie IV - L’évolution

Chapitre 12 - Divergence

12.1

Divergence

Chapitre 13 - Familles de gènes

	13.1	Famille de gènes
	13.2	Gènes des β-globines
	13.3	Famille des β-globines

Partie V - Le DNA au laboratoire

Chapitre 14 - Méthodes d’étude

	14.1	Extraction et purification du DNA
	14.2	Synthèse d’un cDNA
	14.3	Electrophorèse de DNA
	14.4	Hae III (enzyme de restriction)
	14.5	EcoR I
	14.6	Polymorphisme de restriction
	14.7	Polymorphisme Msp I de l’apoA-II
	14.8	Cartes de restriction
	14.9	Hybridation d’une sonde
	14.10	Calcul de la Tm
	14.11	Sonde hybridée
	14.12	Sonde spécifique d’allèle (ASO)
	14.13	Southern blot
	14.14	PCR
	14.15	Didésoxyadénosine triphosphate
	14.16	Réaction de séquence
	14.17	Séquençage d’ADN
	14.18	Gel de séquence

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