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Biologie Moléculaire

Plan du cours

Objectifs PAES commun DHU Paris-Est

I - La structure des acides nucléiques

1 - Molécules simples

2 - Les acides nucléiques

II - Biosynthèse des macromolécules

3 - DNA Définitions

4 - La transcription

5 - La traduction

6 - La réplication

7 - La réparation

III - Les événements génétiques

8 - Substitutions

9 - Mutations

10 - Insertions - délétions

11 - Transpositions

IV - L’évolution

12 - Divergence

13 - Familles de gènes

V - Le DNA au laboratoire

14 - Méthodes d’étude


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traduction HTML V2.8
V. Morice


Partie II - Biosynthèse des macromolécules
Chapitre 4 - La transcription

 

4.6 - DNA binding proteins

 

Image BM_26_2_PICT.jpg
BM 26/2

  • Les protéines qui reconnaissent et se lient au DNA (DNA binding proteins) sont des enzymes, des protéines de structure, des facteurs de transcription et des éléments trans-régulateurs.
  • Dans la structure spatiale de ces protéines, on reconnaît des domaines propres à cette liaison spécifique :
  • Le domaine hélice-boucle-hélice permet le lien spécifique des hélices α avec les nucléotides dans le grand sillon sur une longueur de 10 paires de bases environ.
  • Les doigts de Zinc sont des domaines formés d’un ion Zn++ tétracoordonné avec deux histidines (H) et deux cystéines (C) de la protéine. Chaque doigt de Zinc se lie à cinq nucléotides dans le grand sillon du DNA. Il y a souvent plusieurs doigts de Zinc à la suite dans la même protéine.
  • Certaines protéines ont un domaine riche en acides aminés basiques (K,R) qui se lie aux phosphates des nucléotides. Ces protéines se lient à des séquences répétées inverses sur le DNA, lorsqu’elles sont associées en dimères par la liaison hydrophobe de deux domaines riches en leucine (fermeture « Eclair » à leucines).

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4.1 - Transcription
4.2 - Promoteur
4.3 - Brins sens et antisens
4.4 - Régulation de l’expression
4.5 - Cis et trans régulateurs
4.6 - DNA binding proteins
4.7 - Interaction Protéine DNA
4.8 - Récepteurs nucléaires
4.9 - Régulation du jeûne
4.10 - Régulation de l’effort
4.11 - RNA polymérase II
4.12 - Initiation de la transcription
4.13 - Liaison TFIID sur le DNA
4.14 - Régulation de la RNA polymérase
4.15 - Elongation de la transcription
4.16 - Elongation de la transcription
4.17 - Discontinuité des gènes
4.18 - Exon
4.19 - Exon 1
4.20 - Fin de la transcription
4.21 - Modifications du transcrit
4.22 - Enzyme coiffante
4.23 - Coiffe d’un messager
4.24 - Queue polyA
4.25 - Le transcrit primaire
4.26 - Excision - épissage
4.27 - Formation du lasso
4.28 - Epissages alternatifs
4.29 - Maturation des RNA ribosomiques
4.30 - Stabilité du messager
4.31 - Messager