Site FMPMC
     Page précédentePage suivanteSommaireVersion imprimable
   
 

Biologie génique

Plan du cours

Objectifs

I - Enzymes agissant sur les acides nucléiques

1 - Phosphorylation - déphosphorylation

2 - Les polymérases

3 - Les ligases

4 - Les isomérases

5 - Les nucléases

6 - Autres enzymes

II - Préparation des acides nucléiques

7 - Extraction et purification

8 - Synthèse des polynucléotides

9 - Caractérisation des acides nucléiques

III - Caractérisation des événements génétiques

10 - Mutations

11 - Expression

IV - Le génie génétique

12 - Mutagénèse

13 - Transposition - recombinaison

14 - Construction de vecteurs

15 - Transgénèse


Tous droits de reproduction réservés aux auteurs


traduction HTML V2.8
V. Morice


Plan du cours

 

 

Plan du cours

Objectifs

Partie I - Enzymes agissant sur les acides nucléiques

Chapitre 1 - Phosphorylation - déphosphorylation

  1.1  Polynucléotide-kinase
  1.2  Polynucléotide kinase T4
  1.3  Terminal transferase
  1.4  Phosphatase alcaline

Chapitre 2 - Les polymérases

  2.1  DNA polymérase (réaction)
  2.2  DNA polymérase (exonucléase 3’→5’)
  2.3  DNA polymérase (fonction d’édition)
  2.4  DNA-polymérases (tableau)
  2.5  DNA pol I (E. Coli)
  2.6  Fragment de Klenow
  2.7  T4 DNA polymérase
  2.8  Sequenase
  2.9  Taq polymérase
  2.10  Reverse transcriptase
  2.11  RNA polymérase II (réaction)
  2.12  RNA polymérases (phages)
  2.13  Poly(A) polymérase

Chapitre 3 - Les ligases

  3.1  DNA ligase (réaction)
  3.2  DNA ligase (E. Coli)
  3.3  DNA ligase (phage T4)
  3.4  RNA ligase (phage T4)

Chapitre 4 - Les isomérases

  4.1  Topoisomérase

Chapitre 5 - Les nucléases

  5.1  Fragment de restriction (définition)
  5.2  Système de restriction-modification
  5.3  Nomenclature des enzymes de restriction
  5.4  Restriction (réaction générale)
  5.5  Tampons d’incubation (restriction)
  5.6  EcoR I
  5.7  EcoR V
  5.8  Pvu II
  5.9  Hae III
  5.10  Pvu I
  5.11  Pst I
  5.12  Kpn I
  5.13  Alphabet dégénéré
  5.14  Ava II
  5.15  Hind II
  5.16  Hga I
  5.17  Mbo II
  5.18  Hha I
  5.19  Hpa I
  5.20  Digestion d’une séquence (Hae III)
  5.21  Digestion d’une séquence (Mbo II)
  5.22  Ribonucléase A
  5.23  Ribonucléase T1
  5.24  Ribonucléase H
  5.25  Désoxyribonucléase I
  5.26  Nucléase BAL 31
  5.27  Nucléase S1
  5.28  Nuclease de mung-bean
  5.29  Exonucléase de phage λ
  5.30  Exonucléase III

Chapitre 6 - Autres enzymes

  6.1  β-galactosidase
  6.2  Protéinase K

Partie II - Préparation des acides nucléiques

Chapitre 7 - Extraction et purification

  7.1  Purification des lymphocytes
  7.2  Homogénéisation des tissus, déprotéinisation
  7.3  Extraction de l’ADN
  7.4  Isolation de l’ARN
  7.5  Techniques de purification (tableau)
  7.6  Purification par l’éthanol
  7.7  Purification du RNA-poly(A)

Chapitre 8 - Synthèse des polynucléotides

  8.1  Polymerase Chain Reaction (PCR)
  8.2  PCR (I-1)
  8.3  PCR (I-2)
  8.4  PCR (I-3)
  8.5  PCR (II-1)
  8.6  PCR (II-2)
  8.7  PCR (II-3)
  8.8  PCR (III-1)
  8.9  PCR (III-2)
  8.10  PCR (III-3)
  8.11  Nested-PCR
  8.12  Phosphoramidites : dA-3’-support protégée
  8.13  Phosphoramidites : détritylation
  8.14  Phosphoramidites : addition d’un nucléotide
  8.15  Phosphoramidites : blocage des supports
  8.16  Phosphoramidites : oxydation
  8.17  Phosphoramidites : déprotection
  8.18  Synthèse d’un cDNA
  8.19  Sondes de cDNA amplifié
  8.20  Structures secondaires
  8.21  Synthèse des queues poly(dN)

Chapitre 9 - Caractérisation des acides nucléiques

  9.1  Principaux oligonucléotides
  9.2  Spectres UV des bases nucléiques
  9.3  Spectre UV des acides aminés
  9.4  Dosage des acides nucléiques
  9.5  Electrophorèse des acides nucléiques
  9.6  Sonde nucléique (définition)
  9.7  Hybridation d’une sonde
  9.8  Calcul de la Tm
  9.9  Southern blot
  9.10  Drépanocytose (anémie falciforme)
  9.11  Marquage : nick translation
  9.12  Marquage : random priming
  9.13  Marquage : terminal transferase
  9.14  Marquage : polynucléotide kinase
  9.15  Didésoxyadénosine triphosphate
  9.16  Réaction de séquence
  9.17  Séquençage de l’ADN
  9.18  Séquençage : dye primers
  9.19  Séquençage : dye terminators
  9.20  Gel de séquence
  9.21  Séquençage : image du gel
  9.22  Séquençage : analyse de l’image
  9.23  Séquençage : analyse de l’image
  9.24  Promoteur : foot printing
  9.25  Dosage d’ARN : PCR quantitative
  9.26  Dosage d’ARN : protection à la RNase

Partie III - Caractérisation des événements génétiques

Chapitre 10 - Mutations

  10.1  Polymorphismes de restriction
  10.2  Polymorphisme Msp I de l’apoA-II
  10.3  Haplotypes
  10.4  Cartes de restriction

Chapitre 11 - Expression

  11.1  Vecteur (définition)
  11.2  Cellules-hôtes
  11.3  Cycle du phage λ
  11.4  Phage λ
  11.5  Clonage (I)
  11.6  Clonage (II)
  11.7  EMBL
  11.8  Polylinker
  11.9  Clonage directionnel
  11.10  Carte du plasmide pBR322
  11.11  Carte des plasmides pUC18/19
  11.12  Cycle de M13
  11.13  Carte du M13

Partie IV - Le génie génétique

Chapitre 12 - Mutagénèse

  12.1  Création d’un site de restriction
  12.2  Mutagénèse par PCR

Chapitre 13 - Transposition - recombinaison

  13.1  Transposition (définition)
  13.2  Protéine rec-A
  13.3  Transposition (mécanisme)
  13.4  Recombinaison simple (mitose)
  13.5  Modèle Holliday
  13.6  Crossing-over

Chapitre 14 - Construction de vecteurs

  14.1  Carte du virus SV40
  14.2  Construction d’un vecteur
  14.3  Vecteurs hybrides

Chapitre 15 - Transgénèse

  15.1  Vecteurs de thérapie
  15.2  Souris knock out
     Page précédentePage suivanteSommaireVersion imprimable