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Biologie génique

Plan du cours

Objectifs

I - Enzymes agissant sur les acides nucléiques

1 - Phosphorylation - déphosphorylation

2 - Les polymérases

3 - Les ligases

4 - Les isomérases

5 - Les nucléases

6 - Autres enzymes

II - Préparation des acides nucléiques

7 - Extraction et purification

8 - Synthèse des polynucléotides

9 - Caractérisation des acides nucléiques

III - Caractérisation des événements génétiques

10 - Mutations

11 - Expression

IV - Le génie génétique

12 - Mutagénèse

13 - Transposition - recombinaison

14 - Construction de vecteurs

15 - Transgénèse


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traduction HTML V2.8
V. Morice


Partie I - Enzymes agissant sur les acides nucléiques
Chapitre 5 - Les nucléases

 

5.14 - Ava II

 

Image BG_28_PICT.jpg
BG 28

  • Ava II est une enzyme de restriction produite par Anabaena variabilis.
  • Le site de liaison à l’ADN est formé de cinq paires de nucléotides :
    5’ GGWCC 3’
    3’ CCWGG 5’

  • Les sites de restriction sont souvent de type palindrome, c’est à dire qu’ils sont identiques sur les deux brins de l’ADN (mais antiparallèles sur l’autre brin). Lorsque l’hydrolyse des liaisons phosphodiester se fait loin du centre de symétrie du palindrome certaines paires de nucléotides restent non appariées : les fragments qui en résultent sont dits « à bouts collants ».
  • La méthylation des cytosines du site d’hydrolyse inhibe la reconnaissance du site par Ava II. L’ADN de la bactérie ainsi méthylé n’est pas hydrolysé alors que l’ADN parasite qui n’est pas méthylé sera hydrolysé.

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5.1 - Fragment de restriction (définition)
5.2 - Système de restriction-modification
5.3 - Nomenclature des enzymes de restriction
5.4 - Restriction (réaction générale)
5.5 - Tampons d’incubation (restriction)
5.6 - EcoR I
5.7 - EcoR V
5.8 - Pvu II
5.9 - Hae III
5.10 - Pvu I
5.11 - Pst I
5.12 - Kpn I
5.13 - Alphabet dégénéré
5.14 - Ava II
5.15 - Hind II
5.16 - Hga I
5.17 - Mbo II
5.18 - Hha I
5.19 - Hpa I
5.20 - Digestion d’une séquence (Hae III)
5.21 - Digestion d’une séquence (Mbo II)
5.22 - Ribonucléase A
5.23 - Ribonucléase T1
5.24 - Ribonucléase H
5.25 - Désoxyribonucléase I
5.26 - Nucléase BAL 31
5.27 - Nucléase S1
5.28 - Nuclease de mung-bean
5.29 - Exonucléase de phage λ
5.30 - Exonucléase III